Cytométrie en flux : analyses multidimensionnelles non supervisées avec FlowJo - Niveau expert Présentiel

Dernière mise à jour : 09/02/2026

Unité de recherche

Description

Cette formation permet d'initier les participants à l'utilisation des différents algorithmes existants dans FlowJo mais également d'acquérir une méthodologie pour réaliser une analyse non supervisée.

Cours

Installation des plugins FlowJo :
- où les télécharger, comment les installer ?
Présentation des différents algorithmes disponibles dans FlowJo : avantages / inconvénients, quels sont les points critiques ?
- nettoyage des données : check sample quality, FlowClean, FlowAI, PeacoQC
- batch effect : CytoNorm, cycombine
- outils de dimension de réduction : t-SNE, UMAP
- outils de clustering : Phenograph, FlowSOM, X-Shift
- outils d'interprétation des résultats : Cluster Explorer

Travaux dirigés

Installation des plugins FlowJo
Utilisation et comparaison des différents outils de nettoyage : check sample quality vs FlowClean, FlowAI, PeacoQC
Utilisation et comparaison des outils de dimension de réduction : t-SNE et UMAP
Utilisation et comparaison des outils de clustering : Phenograph, FlowSOM
Utilisation des outils d'interprétation : Cluster explorer

Objectifs de la formation

Connaître et comprendre les algorithmes disponibles dans FlowJo pour réaliser une analyse multidimensionnelle non supervisée
Connaître les différentes étapes ou "workflow" pour réaliser une analyse non supervisée avec le logiciel FlowJo
Présentation et démonstration des différents algorithmes
Savoir réaliser une analyse non supervisée complète avec le logiciel FlowJo (du nettoyage des données jusqu'à l'interprétation des résultats)

Public visé

Chercheurs, ingénieurs et techniciens pratiquant régulièrement la cytométrie en flux multiparamétriques.

Prérequis

Bonnes connaissances en cytométrie en flux multiparamétriques

Bonnes connaissances du logiciel FlowJo pour le retraitement des données ou avoir suivi la formation "Cytométrie en Flux : retraitement des données avec le logiciel FlowJo" ou niveau équivalent

Modalités pédagogiques

Alternance de cours (4,5 h) et de travaux dirigés (3 h).

Moyens et supports pédagogiques

Il sera demandé aux participants de venir avec leur propre ordinateur.

Pour le cours, un tutoriel sera remis au participant ; pour les TD, des fichiers au format PDF seront remis au participant.

Modalités d'évaluation et de suivi

Un suivi individualisé par des évaluations formatives est assuré. Une attestation de fin de formation est délivrée à la fin du parcours.

Formateurs

ISCACHE Anne-Laure

Responsable scientifique

Informations sur l'admission

L'admission à cette formation ne fait l'objet d'aucun examen, test ou sélection préalable ; l'inscription est validée après réception du dossier complet et confirmation par l'organisme de formation.

Modalités tarifaires spécifiques

Nos formations sont exonérées de TVA. Elles bénéficient de remises volumes : - 5% pour 3-4 inscrits, - 10% pour 5-6 inscrits, et - 20% à partir de 7 personnes. Une réduction de 20% est appliquée pour les agents salariés du CNRS.

Informations sur l'accessibilité

Notre organisme s'engage à garantir l'accessibilité de ses formations à distance et en présentiel aux personnes en situation de handicap. Un référent handicap est mobilisable afin d'analyser les besoins spécifiques et de mettre en place, lorsque cela est possible, les adaptations pédagogiques, techniques ou organisationnelles nécessaires.

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Choix de la session

le 12/10/26 de 09:00 à 17:00 - INFINITY – VDPE – TOULOUSE - TOULOUSE (31)
9 places restantes

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Catégorie : Biologie cellulaire et microbiologie
Durée : 7h
Prix : 721 € Net de taxe

Prix INTRA : Nous consulter
Référence : MOD_2025267
Satisfaction :

★★★★★

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Inscription rapide et flexible

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Session sélectionnée

12/10/26 9:00 → 17:00
INFINITY – VDPE – TOULOUSE - TOULOUSE (31) 9 places restantes

Détails :
12/10/26 :	9:00 → 12:30
	13:30 → 17:00

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