Scripts en Python pour la bioinformatique et environnement Linux Présentiel
Dernière mise à jour : 06/10/2025
Description
1er jour
- Matin : système linux et commandes de base
- Après-midi : bases de python, notions de variables et structures de contrôles
2ème jour
- Matin : scripts python : format, utilisation, fonction, exécution
- Après-midi : rédaction et correction de scripts
3ème jour
- Matin : bases de la librairie pandas
- Après-midi : analyse et exploitation de données tabulaires avec pandas
4ème jour
- Matin : analyse de données des participants
Objectifs de la formation
- S'initier au développement en Python
- Connaître les principes et les avantages du système Linux
- Connaître et savoir utiliser les commandes de base permettant de lancer des programmes sous Linux
- Comprendre, rédiger et savoir lancer des scripts en python
- Charger et utiliser des librairies python existante
Public visé
Biologistes, bio-analystes, professionnels des sciences du vivant ayant besoin d'analyser des données
Toute personne désireuse de savoir analyser ou visualiser des données grâce à des scripts personnalisés
Toute personne désireuse de savoir analyser ou visualiser des données grâce à des scripts personnalisés
Prérequis
Notions de base en informatique : fichiers, répertoires, compression de fichiers, formats de fichiers texte et tabulaires (par CSV).
Moyens et supports pédagogiques
EQUIPEMENT : Un ordinateur préinstallé sous linux sera fourni aux participant.e.s, ainsi qu'un polycopié des cours (PDF ou imprimé au choix).
Liste des ressources pédagogiques remises aux participants à l'issue de la formation : polycopiés de cours et sujets de travaux en papier et/ou dématérialisés.
Modalités d'évaluation et de suivi
Un suivi individualisé par des évaluations formatives est assuré. Une attestation de fin de formation est délivrée à la fin du parcours.
Formateurs
RE
RIVALS Eric
Responsable scientifique
Modalités tarifaires spécifiques
Nos formations sont exonérées de TVA. Elles bénéficient de remises volumes : - 5% pour 3-4 inscrits, - 10% pour 5-6 inscrits, et - 20% à partir de 7 personnes. Une réduction de 20% est appliquée pour les agents salariés du CNRS.
Informations sur l'accessibilité
Notre laboratoire est entièrement accessible aux personnes à mobilité réduite (PMR). Un accès adapté, des espaces de circulation et des sanitaires spécifiques sont à votre disposition pour garantir votre confort et votre autonomie. Pour toute information complémentaire, veuillez nous contacter.