Cytométrie en flux : retraitement des données avec FlowJo À distance

Cette formation permet aux participants de maîtriser l'ensemble des outils disponibles avec le logiciel FlowJo pour analyser des données multiparamétriques de cytométrie en toute autonomie. Cette formation pourra être poursuivie par une formation consacrée aux analyses avancées "Cytométrie en Flux : Analyses multidimensionnelles non supervisées à l'aide du logiciel FlowJo – Niveau Expert".

• Présentation générale du logiciel et de ses fonctionnalités
• Présentation des outils de base au travers d'une analyse simple :
  • Workspace : organisation de l'espace de travail, comment créer / modifier une stratégie d'analyse et l'appliquer
  • Table Editor : création de rapports statistiques simples
  • Layout Editor : création de rapports graphiques simples (batch, overlay, mise en page)
• Compensations : rappels des principes de compensation, contrôler et valider la matrice de compensation.
• Création d'une matrice de compensation en mode automatique
• Réglages des préférences du logiciel
• Organisation et automatisation de l'expérience : création automatique de groupes, itération, mots clés, métadonnées, fonction concaténation
• Création de rapports statistiques complexes : création de formules, mise en forme des résultats statistiques (heat map, valeur de référence)
• Création de rapports graphiques complexes : Batch complexes (itération par panel, mots clés)
• Utilisation des modules d'analyses spécifiques de cytométrie en flux : cycle cellulaire, prolifération

Dernière demi-journée consacrée à l'analyse de jeux de données apportés par les participants à des fins pédagogiques sous réserve de l'accord préalable de la responsable de la formation.

• Connaître les outils de base de FlowJo pour l'analyse de données de cytométrie en flux multiparamétrique
• Savoir modifier et créer une matrice de compensation
• Faire des analyses automatisées simples (batch simple) et complexes (analyses multiparamétriques ou expériences de variables multiples patients, dates, batch complexe)
• Connaître et comprendre les modules d'analyses spécifiques de cytométrie en flux (cycle cellulaire, prolifération)