Préparer des banques pour les technologies NGS Illumina et Nanopore : les étapes pratiques et méthodologiques appliquées au séquençage short et long reads Présentiel
Dernière mise à jour : 08/10/2025
Description
Module théorique (5 h)
- La technologie de séquençage Illumina
- Les principales méthodes de construction de banques NGS
- Format des données générées et généralités sur l'analyse primaire des données
- Potentiel des applications de séquençage (illustrations, exemplifications)
Module pratique (12 h)
- Un exemple de construction de banques à partir d'ADN : séquençage de petits génomes
- Un exemple de construction de banques à partir d'ARN : séquençage RNAseq
- Quantification et qualification des ADN et des ARN
- Construction d'une banque à partir d'ADN et d'ARN
- Contrôle qualité de banques avant séquençage
- Séquençage sur plateforme Illumina (NextSeq500)
- Récupération des données de séquençage et critères de validation
La dernière demi-journée (3 h) sera consacrée à l'analyse de cas exposés par les participants (questions spécifiques, projets propres de séquençage)
Objectifs de la formation
- Comprendre les technologies de séquençage Illumina
- Savoir identifier les points limitants avant le développement d'un projet de séquençage
- Acquérir les compétences pratiques et théoriques pour la réalisation de ses projets NGS
- Maîtriser les étapes de construction et de validation d'une banque NGS pour être autonome
- Maîtriser les équipements pour la quantification et qualification des acides nucléiques et la sélection de taille
Public visé
Chercheurs, ingénieurs et techniciens intéressés par le volet pratique du séquençage NGS
Prérequis
Connaissances de base en biologie moléculaire
Modalités pédagogiques
- Alternance de cours (5 h) et de travaux pratiques et dirigés (15 h)
- TP en binômes avec 1 intervenant pour 2 binômes maximum
Moyens et supports pédagogiques
Thermocycler Veriti, Qubit, Nanodrop, Tapestation 2200, séquenceur Illumina NextSeq500
Un support papier sera mis à disposition du participant.
Modalités d'évaluation et de suivi
Un suivi individualisé par des évaluations formatives est assuré. Une attestation de fin de formation est délivrée à la fin du parcours.
Formateurs
GB
GILLET Benjamin
Responsable scientifique
HS
HUGHES Sandrine
Responsable scientifique
Modalités tarifaires spécifiques
Nos formations sont exonérées de TVA. Elles bénéficient de remises volumes : - 5% pour 3-4 inscrits, - 10% pour 5-6 inscrits, et - 20% à partir de 7 personnes. Une réduction de 20% est appliquée pour les agents salariés du CNRS.
Informations sur l'accessibilité
Notre laboratoire est entièrement accessible aux personnes à mobilité réduite (PMR). Un accès adapté, des espaces de circulation et des sanitaires spécifiques sont à votre disposition pour garantir votre confort et votre autonomie. Pour toute information complémentaire, veuillez nous contacter.