Ingénierie du génome associée à CRISPR pour générer des mutations sans cicatrice chez les bactéries Présentiel

AXE 12 - Biologie moléculaire et biochimie

Environnement scientifique et technique de la formation

Laboratoire de microbiologie et de génétique moléculaires
https://cbi-toulouse.fr

Service d'ingénierie génétique
https://cbi-toulouse.fr/fr/equipe-service-ing
enierie-genetique

Ingénierie du génome associée à CRISPR pour générer des mutations sans cicatrice chez les bactéries

PROGRAMME

LIEU
TOULOUSE (31)

ORGANISATION
35 h
8 stagiaires maximum
Lieux accessibles aux PMR

COÛT PÉDAGOGIQUE
2040 Euros

À L'ISSUE DE LA FORMATION
Evaluation de la formation par les stagiaires
Envoi d'une attestation de formation

DATE DU STAGE
Réf. 25 239 : du lundi 23/06/25 à 09:00 au vendredi 27/06/25 à 17:00

Matériel standard d'un laboratoire de biologie moléculaire et de microbiologie.
Il est demandé aux stagiaires de se munir de leur propre ordinateur portable avec les droits administrateurs afin de pouvoir installer en début de stage les logiciels nécessaires à la formation.

• Connaître les principes de la contre-sélection grâce au système CRISPR-Cas9
• Définir et exprimer un ARN guide
• Définir et construire un ADN mutagène
• Sélectionner les clones porteurs de la mutation d'intérêt
• Modifier le génome d'Escherichia coli (E. coli) sans laisser de cicatrice sur son chromosome

Tout au long de la formation, des cas pratiques ou exercices corrigés permettront à l'apprenant d'évaluer l'acquisition des compétences.
Un support papier et un fichier au format PDF seront mis à disposition des stagiaires.

Alternance de cours et de travaux pratiques et dirigés

TP mis en place par un technicien et encadrés par une intervenante pour 4 stagiaires maximum

Cours

• Les méthodes d'ingénierie génétique chez E. coli
• Leurs intérêts et leurs limites
• Les systèmes CRISPR : une immunité adaptative bactérienne unique
• L'utilisation du système CRISPR-Cas9 pour contre-sélectionner certaines bactéries
• Comment modifier le génome bactérien sans générer de cicatrice au niveau de sa séquence ?

Travaux pratiques et dirigés

• Présentation du système expérimental : souche, plasmides « helpers »
• Design et construction de l'ADN mutagène
• Design et clonage de l'ARN guide permettant la contre-sélection des bactéries « wild type »
• Mise en place du système expérimental : transformation, sélection, vérification
• Elimination des plasmides « helpers »