Transparisation et Imagerie 3D d’échantillons biologiques épais et opaques Présentiel

La formation a pour but de former les participants aux techniques de transparisation pour les échantillons biologiques et à leur imagerie. Le matin, il y aura donc des cours théoriques donnés par différents experts du milieu : transparisation, imagerie en profondeur, analyse de ces images 3D. Les après-midi sont consacrés à la mise en pratique de ce qui aura été vus le matin dans 4 TP différents : transparisation des échantillons, imagerie en microscopie à feuille de lumière, comparaison de l'imagerie en profondeur en confocal versus biphoton, analyse d'image 3D.

Tout au long de la formation, des travaux pratiques permettront à l'apprenant d'évaluer l'acquisition des compétences et connaissances. A la fin de la formation, un bilan oral sera fait avec l'ensemble des participants pour savoir comment ils appliqueront ce qui a été appris une fois de retour dans leur laboratoire respectif.

Un fichier au format PDF sera mis à disposition du stagiaire.

• Connaître, distinguer et comparer les différentes méthodes de transparisation
• Sélectionner le type de microscopie en fonction de l'échantillon transparisé
• Mettre en œuvre / mettre en pratique un protocole de transparisation et préparer l'échantillon pour l'imagerie
• Analyser et traiter des données
• Communiquer avec les acteurs de la communauté pour présenter ses résultats / difficultés et déterminer les moyens d'optimiser

• Connaître les bases de la microscopie à fluorescence
• Maitriser les techniques d'immunohistochimie
• Travailler sur échantillons biologiques

• Alternance de cours interactifs (16 h) et de travaux pratiques (16 h)

• Microscope confocal
• Microscope multi-photonique
• Microscope à feuille de lumière
• Loupe binoculaire à fluorescence
• Logiciels : ImageJ, logiciel de Réalité Virtuelle (RV) Arivis et équipement pour regarder en RV