ImageJ / FIJI : traitement et analyse d’images de microscopie Présentiel
Dernière mise à jour : 19/11/2025
Description
Jour 1
- Introduction aux images numériques (Cours/Echanges)
- Installation et configuration d'ImageJ-Fiji (Cours/Echanges)
- Ouverture et visualisation des images (Pratique/Echanges/Exercices)
- Création d'une planche d'images pour la publication (Pratique/Echanges/Exercices)
Jour 2
- Traitement des images tridimensionnelles (Pratique/Echanges/Exercices)
- Traitement des images numériques (Pratique/Echanges/Exercices)
- Quantification des images numériques (Pratique/Echanges/Exercices)
Jour 3
- Initiation au tracking d'évènements dynamiques (Pratique/Echanges)
- Initiation à la mesure de colocalisation (Pratique/Echanges)
- Initiation à l'automatisation (Pratique/Echanges/Exercices)
- Travail sur les problématiques et images des participants (Pratique)
Objectifs de la formation
- Connaitre les propriétés des images numériques
- Effectuer des montages pour publier des figures de microscopie
- Acquérir les bases du traitement d'image (réduction du bruit, alignement)
- Acquérir les bases de la quantification des données provenant d'images (dénombrement, mesure de taille et forme)
- Aborder des applications avancées en analyse d'image (tracking, colocalisation, automatisation)
Public visé
Etudiants, chercheurs, ingénieurs, techniciens souhaitant acquérir les bases du traitement et de l'analyses des images numériques. Toute la formation s'appuie sur des exemples et des problématiques de biologie cellulaire.
Prérequis
Il est souhaitable que les participants aient déjà produit des images numériques.
Modalités pédagogiques
Cours interactifs (2 h) et travaux dirigés (19 h) animés par un intervenant pour 5 stagiaires maximum.
Moyens et supports pédagogiques
Un support papier comprenant tous les cours et les TP sera remis aux participants, ainsi qu'une clé USB comportant les versions numériques des présentations et les outils d'analyse d'image.
Modalités d'évaluation et de suivi
Un suivi individualisé par des évaluations formatives est assuré. Une attestation de fin de formation est délivrée à la fin du parcours.
Formateurs
LR
LE BARS Romain
Responsable scientifique
Modalités tarifaires spécifiques
Nos formations sont exonérées de TVA. Elles bénéficient de remises volumes : - 5% pour 3-4 inscrits, - 10% pour 5-6 inscrits, et - 20% à partir de 7 personnes. Une réduction de 20% est appliquée pour les agents salariés du CNRS.
Informations sur l'accessibilité
Notre laboratoire est entièrement accessible aux personnes à mobilité réduite (PMR). Un accès adapté, des espaces de circulation et des sanitaires spécifiques sont à votre disposition pour garantir votre confort et votre autonomie. Pour toute information complémentaire, veuillez nous contacter.