Microscopie à épi-fluorescence et microscopie confocale : des bases à la pratique Présentiel
Dernière mise à jour : 03/07/2026
Description
Cours théoriques :
• Microscopie de base : Alignement du condenseur, microscopie de transmission, contraste de phase et contraste interférentiel différentiel
• Microscopie à épi-fluorescence : Principe, filtres, objectifs, résolution
• Détecteurs pour la microscopie de fluorescence : caméra CCD, EMCCD
• Fluorescence : définitions, aspects théoriques et pratiques : les différentes sondes fluorescentes, les protéines auto-fluorescentes
• La microscopie confocale (physique de l'instrument, principe des lasers et sécurité, acquisition,
numérisation, échantillonnage, multiples marquages…)
• Applications et développements en microscopie : FRET, FRAP, FLIM, TIRF, super résolution…
Mise en pratique :
Un cycle de 8 heures de mise en pratique et de démonstration permettra de renforcer le lien entre théorie
et application, de reconnaître les éléments mis en oeuvre en microscopie ; et d'acquérir des images.
Ce cycle permettra aux participants d'utiliser les microscopes (microscopie plein champ et/ou confocale) sur leurs propres échantillons.
Pour 12 personnes, il y a un cycle de 4 Travaux Pratiques (les séances TP 1, 2, 3, 4) de 2h pour 2 groupes puis un
cycle de Travaux Pratiques (séance TP 5) de 7h pour 3 groupes
TP 1 : Microscopie à épi-fluorescence et transmission : reconnaître les éléments mis en oeuvre : alignement
Koehler du microscope et mode phase, filtres, trajets optiques, acquisition de PSF en vue de la
déconvolution
1 groupe de 4 personnes, sur microscope à épi-fluorescence
TP 2 : Microscopie confocale I : trajet optique, acquisition d'images de fluorescence, transmission DIC,
réflectance, reconstruction 3D
1 groupe de 4 personnes, sur microscope confocal
TP 3 : Microscopie confocale II: acquisition multiparamétrique, acquisition simultanée /séquentielle,
acquisition spectrale, colocalisation
1 groupe de 4 personnes, sur microscope confocal
TP 4 : Vidéo-microscopie : acquisition multiparamétrique, en profondeur, sur cellules vivantes
1 groupe de 4 personnes, sur vidéo-microscope
TP 5 : Mise en pratique sur échantillons des participants sur les microscopes de la BIC
4 groupes, sur microscope confocal droit, microscope à épi-fluorescence, vidéo-microscope
• Microscopie de base : Alignement du condenseur, microscopie de transmission, contraste de phase et contraste interférentiel différentiel
• Microscopie à épi-fluorescence : Principe, filtres, objectifs, résolution
• Détecteurs pour la microscopie de fluorescence : caméra CCD, EMCCD
• Fluorescence : définitions, aspects théoriques et pratiques : les différentes sondes fluorescentes, les protéines auto-fluorescentes
• La microscopie confocale (physique de l'instrument, principe des lasers et sécurité, acquisition,
numérisation, échantillonnage, multiples marquages…)
• Applications et développements en microscopie : FRET, FRAP, FLIM, TIRF, super résolution…
Mise en pratique :
Un cycle de 8 heures de mise en pratique et de démonstration permettra de renforcer le lien entre théorie
et application, de reconnaître les éléments mis en oeuvre en microscopie ; et d'acquérir des images.
Ce cycle permettra aux participants d'utiliser les microscopes (microscopie plein champ et/ou confocale) sur leurs propres échantillons.
Pour 12 personnes, il y a un cycle de 4 Travaux Pratiques (les séances TP 1, 2, 3, 4) de 2h pour 2 groupes puis un
cycle de Travaux Pratiques (séance TP 5) de 7h pour 3 groupes
TP 1 : Microscopie à épi-fluorescence et transmission : reconnaître les éléments mis en oeuvre : alignement
Koehler du microscope et mode phase, filtres, trajets optiques, acquisition de PSF en vue de la
déconvolution
1 groupe de 4 personnes, sur microscope à épi-fluorescence
TP 2 : Microscopie confocale I : trajet optique, acquisition d'images de fluorescence, transmission DIC,
réflectance, reconstruction 3D
1 groupe de 4 personnes, sur microscope confocal
TP 3 : Microscopie confocale II: acquisition multiparamétrique, acquisition simultanée /séquentielle,
acquisition spectrale, colocalisation
1 groupe de 4 personnes, sur microscope confocal
TP 4 : Vidéo-microscopie : acquisition multiparamétrique, en profondeur, sur cellules vivantes
1 groupe de 4 personnes, sur vidéo-microscope
TP 5 : Mise en pratique sur échantillons des participants sur les microscopes de la BIC
4 groupes, sur microscope confocal droit, microscope à épi-fluorescence, vidéo-microscope
Objectifs de la formation
- Acquérir les bases théoriques en microscopie à épi-fluorescence et microscopie confocale (Cours)
- S'informer des nouvelles applications en microscopie à épi-fluorescence et confocale
- S'initier à l'utilisation pratique d'un microscope à épi-fluorescence et d'un microscope confocal (TP)
- S'informer des nouvelles applications en microscopie à épi-fluorescence et confocale
- S'initier à l'utilisation pratique d'un microscope à épi-fluorescence et d'un microscope confocal (TP)
Modalités d'évaluation et de suivi
Un suivi individualisé par des évaluations formatives est assuré. Une attestation de suivi de formation est délivrée à la fin du parcours.
Formateurs
Informations sur l'admission
L'admission à cette formation ne fait l'objet d'aucun examen, test ou sélection préalable ; l'inscription est validée après réception du dossier complet et confirmation par l'organisme de formation.
Informations sur l'accessibilité
Notre organisme s'engage à garantir l'accessibilité de ses formations à distance et en présentiel aux personnes en situation de handicap. Un référent handicap est mobilisable afin d'analyser les besoins spécifiques et de mettre en place, lorsque cela est possible, les adaptations pédagogiques, techniques ou organisationnelles nécessaires.
